Сюжет второго Homeworld является попыткой вытащить на свет законченный продукт и сделать его коммерчески успешным в рамках ограничений по времени и доступным средствам. Глянь хотя бы
здесь,
здесь или
здесь, там на эту тему сломали немало копий. А вообще, как не раз уже было подмечено, латать дыры в сюжете ХВ2 – дело неблагодарное.