Большое количество разных по характеристикам юнитов при любом раскладе ведёт к проблеме лишних юнитов
А если речь про эксклюзивность с точки зрения только морд... Дать разную раскраску и всё =) Более того, а смысл? Мы же играем за отдельный киит (хвк) или за объединённый флот (хв1-2), у которых строго свои цвета =) К примеру в хв2 во 2-й миссии были фрегаты киита Собани, которые как раз-таки отличались от нашего флота раскраской (и характеристиками, что, думаю, объясняется тем, что они должны были выиграть, либо тем, что Собани - элитные и мегакрутые

).
А вот менять конструкцию смысла нет, имхо, лучше просто навешивать разные орудия, системы (те же сенсоры) и т.п.